MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803

Total Repeats: 66792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020286	GC	3	6	2	7	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020286	GTG	2	6	68	73	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020286	GCG	2	6	88	93	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020286	TCT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020286	GGT	2	6	202	207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020286	ATT	2	6	211	216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020286	A	6	6	306	311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020286	CT	3	6	328	333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020286	TG	4	8	385	392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020286	ATC	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020286	CCGG	2	8	488	495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020286	AATT	2	8	567	574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020286	GA	3	6	721	726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020286	GTC	2	6	759	764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020286	T	6	6	786	791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020286	T	6	6	836	841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020286	TGC	2	6	971	976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451813331
18	NC_020286	CCA	2	6	1026	1031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451813331
19	NC_020286	GCG	2	6	1089	1094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451813331
20	NC_020286	C	6	6	1162	1167	0 %	0 %	0 %	100 %	451813331
21	NC_020286	TCC	2	6	1173	1178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451813331
22	NC_020286	CCA	2	6	1202	1207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451813331
23	NC_020286	CCCTA	2	10	1278	1287	20 %	20 %	0 %	60 %	451813331
24	NC_020286	CAG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451813331
25	NC_020286	GAA	2	6	1417	1422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451813331
26	NC_020286	A	6	6	1471	1476	100 %	0 %	0 %	0 %	451813331
27	NC_020286	CTCC	2	8	1501	1508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_020286	C	6	6	1507	1512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_020286	ATC	2	6	1565	1570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020286	GCC	2	6	1613	1618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451813332
31	NC_020286	GAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451813332
32	NC_020286	CAGG	2	8	1643	1650	25 %	0 %	50 %	25 %	451813332
33	NC_020286	TGG	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451813332
34	NC_020286	A	6	6	1724	1729	100 %	0 %	0 %	0 %	451813332
35	NC_020286	TCA	2	6	1806	1811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451813332
36	NC_020286	CCT	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451813332
37	NC_020286	GTG	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451813332
38	NC_020286	GGT	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451813332
39	NC_020286	AAC	2	6	2016	2021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451813332
40	NC_020286	TTTG	2	8	2090	2097	0 %	75 %	25 %	0 %	451813332
41	NC_020286	GAA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020286	C	6	6	2228	2233	0 %	0 %	0 %	100 %	451813333
43	NC_020286	GTC	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451813333
44	NC_020286	TGGAG	2	10	2411	2420	20 %	20 %	60 %	0 %	451813333
45	NC_020286	CCA	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451813333
46	NC_020286	AAT	2	6	2750	2755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451813333
47	NC_020286	GCG	2	6	2797	2802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451813333
48	NC_020286	T	8	8	2817	2824	0 %	100 %	0 %	0 %	451813333
49	NC_020286	CAT	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451813333
50	NC_020286	GTT	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451813333
51	NC_020286	TAT	2	6	2906	2911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020286	GCG	2	6	2923	2928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020286	AC	3	6	2930	2935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020286	A	6	6	2940	2945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020286	TTCA	2	8	3013	3020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020286	AGC	2	6	3048	3053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020286	TCA	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451813334
58	NC_020286	ATCG	2	8	3324	3331	25 %	25 %	25 %	25 %	451813334
59	NC_020286	GTT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451813334
60	NC_020286	ATT	2	6	3387	3392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451813334
61	NC_020286	AAT	2	6	3402	3407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451813334
62	NC_020286	TGG	2	6	3524	3529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451813334
63	NC_020286	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451813334
64	NC_020286	AGGT	2	8	3751	3758	25 %	25 %	50 %	0 %	451813334
65	NC_020286	AAG	2	6	3784	3789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451813334
66	NC_020286	TTG	2	6	3853	3858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451813334
67	NC_020286	CAA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451813334
68	NC_020286	GGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451813334
69	NC_020286	TCA	2	6	4234	4239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451813334
70	NC_020286	GTT	2	6	4272	4277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020286	CAAT	2	8	4303	4310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020286	G	7	7	4391	4397	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020286	TTG	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020286	AGT	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451813335
75	NC_020286	GTT	2	6	4459	4464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451813335
76	NC_020286	TGG	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451813335
77	NC_020286	AAT	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451813335
78	NC_020286	TGG	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451813335
79	NC_020286	TCT	2	6	4869	4874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451813335
80	NC_020286	CAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451813335
81	NC_020286	TTC	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451813335
82	NC_020286	TCT	2	6	5013	5018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451813335
83	NC_020286	CA	3	6	5066	5071	50 %	0 %	0 %	50 %	451813335
84	NC_020286	T	6	6	5078	5083	0 %	100 %	0 %	0 %	451813335
85	NC_020286	TGG	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451813335
86	NC_020286	CAT	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451813335
87	NC_020286	C	6	6	5178	5183	0 %	0 %	0 %	100 %	451813335
88	NC_020286	AATT	2	8	5309	5316	50 %	50 %	0 %	0 %	451813335
89	NC_020286	CAA	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451813335
90	NC_020286	TGGT	2	8	5389	5396	0 %	50 %	50 %	0 %	451813335
91	NC_020286	AGGG	2	8	5415	5422	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020286	CCA	2	6	5456	5461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_020286	GTT	2	6	5486	5491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020286	CCA	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451813336
95	NC_020286	TAA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451813336
96	NC_020286	TCA	2	6	5766	5771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451813336
97	NC_020286	CCA	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451813336
98	NC_020286	CGG	2	6	6036	6041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451813336
99	NC_020286	G	6	6	6040	6045	0 %	0 %	100 %	0 %	451813336
100	NC_020286	GGT	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451813336
101	NC_020286	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451813336
102	NC_020286	TCT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451813336
103	NC_020286	GCG	2	6	6398	6403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451813336
104	NC_020286	GTG	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451813336
105	NC_020286	GAT	2	6	6478	6483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451813336
106	NC_020286	ATG	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451813336
107	NC_020286	CAA	3	9	6548	6556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451813336
108	NC_020286	AAC	2	6	6602	6607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451813336
109	NC_020286	A	6	6	6800	6805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020286	ACTG	2	8	6868	6875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020286	ATT	2	6	6924	6929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020286	ATT	2	6	6934	6939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020286	A	6	6	7068	7073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020286	CAA	2	6	7300	7305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451813337
115	NC_020286	GGTT	2	8	7319	7326	0 %	50 %	50 %	0 %	451813337
116	NC_020286	TGA	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451813337
117	NC_020286	CCA	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451813337
118	NC_020286	TCA	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451813337
119	NC_020286	CGC	2	6	7387	7392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451813337
120	NC_020286	C	6	6	7394	7399	0 %	0 %	0 %	100 %	451813337
121	NC_020286	AAC	2	6	7451	7456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451813337
122	NC_020286	ATC	2	6	7457	7462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451813337
123	NC_020286	TGT	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451813337
124	NC_020286	CTT	2	6	7479	7484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451813337
125	NC_020286	GGT	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451813337
126	NC_020286	GTA	2	6	7571	7576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451813337
127	NC_020286	GTC	2	6	7611	7616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451813337
128	NC_020286	TG	3	6	7658	7663	0 %	50 %	50 %	0 %	451813337
129	NC_020286	CCG	2	6	7692	7697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451813337
130	NC_020286	GGT	2	6	7847	7852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451813337
131	NC_020286	CCT	3	9	7887	7895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451813337
132	NC_020286	ACC	2	6	7907	7912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451813337
133	NC_020286	AAG	3	9	7950	7958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451813337
134	NC_020286	ACA	2	6	7965	7970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451813337
135	NC_020286	GCC	2	6	7976	7981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451813337
136	NC_020286	CTT	2	6	8016	8021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451813337
137	NC_020286	CAA	2	6	8023	8028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451813337
138	NC_020286	CTT	3	9	8044	8052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451813337
139	NC_020286	TTCAAC	2	12	8126	8137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451813337
140	NC_020286	CTG	2	6	8295	8300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451813337
141	NC_020286	AAT	2	6	8334	8339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020286	G	6	6	8364	8369	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020286	TCT	2	6	8392	8397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_020286	ATCG	2	8	8418	8425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020286	AG	3	6	8452	8457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020286	GAA	2	6	8498	8503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451813338
147	NC_020286	CGG	2	6	8511	8516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451813338
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149	NC_020286	CCT	2	6	8553	8558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451813338
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151	NC_020286	G	6	6	8601	8606	0 %	0 %	100 %	0 %	451813338
152	NC_020286	TC	3	6	8646	8651	0 %	50 %	0 %	50 %	451813338
153	NC_020286	TTG	2	6	8681	8686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451813338
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155	NC_020286	AAAG	2	8	8709	8716	75 %	0 %	25 %	0 %	451813338
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157	NC_020286	TGG	2	6	8868	8873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451813338
158	NC_020286	TGA	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451813338
159	NC_020286	ACC	2	6	8959	8964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451813338
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162	NC_020286	TAC	2	6	9114	9119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451813338
163	NC_020286	TC	3	6	9123	9128	0 %	50 %	0 %	50 %	451813338
164	NC_020286	AAT	2	6	9281	9286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451813338
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185	NC_020286	A	7	7	10480	10486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_020286	CAA	2	6	10631	10636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451813339
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240	NC_020286	CCTA	2	8	13483	13490	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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267	NC_020286	TGTT	2	8	14607	14614	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
268	NC_020286	TTAC	2	8	14716	14723	25 %	50 %	0 %	25 %	451813342
269	NC_020286	ATT	2	6	14733	14738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451813342
270	NC_020286	TATT	2	8	14741	14748	25 %	75 %	0 %	0 %	451813342
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272	NC_020286	TCCC	2	8	14777	14784	0 %	25 %	0 %	75 %	451813342
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402	NC_020286	GTT	2	6	22259	22264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451813347
403	NC_020286	CTT	2	6	22265	22270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451813347
404	NC_020286	TAC	2	6	22287	22292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451813347
405	NC_020286	TCC	2	6	22300	22305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451813347
406	NC_020286	C	6	6	22313	22318	0 %	0 %	0 %	100 %	451813347
407	NC_020286	CTC	2	6	22320	22325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451813347
408	NC_020286	AAT	2	6	22336	22341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451813347
409	NC_020286	TCC	2	6	22360	22365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451813347
410	NC_020286	A	6	6	22431	22436	100 %	0 %	0 %	0 %	451813347
411	NC_020286	AT	3	6	22472	22477	50 %	50 %	0 %	0 %	451813347
412	NC_020286	A	6	6	22486	22491	100 %	0 %	0 %	0 %	451813347
413	NC_020286	CAA	2	6	22500	22505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451813347
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421	NC_020286	TAC	2	6	22719	22724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451813347
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424	NC_020286	A	6	6	22853	22858	100 %	0 %	0 %	0 %	451813347
425	NC_020286	TACA	2	8	22881	22888	50 %	25 %	0 %	25 %	451813347
426	NC_020286	T	6	6	22918	22923	0 %	100 %	0 %	0 %	451813347
427	NC_020286	AAT	2	6	22932	22937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451813347
428	NC_020286	A	6	6	22986	22991	100 %	0 %	0 %	0 %	451813347
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432	NC_020286	ATTA	2	8	23134	23141	50 %	50 %	0 %	0 %	451813348
433	NC_020286	TCA	2	6	23216	23221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451813348
434	NC_020286	ATC	2	6	23322	23327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451813348
435	NC_020286	CAA	2	6	23399	23404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451813348
436	NC_020286	GTT	2	6	23453	23458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451813348
437	NC_020286	CTT	2	6	23468	23473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451813348
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441	NC_020286	CAA	2	6	23699	23704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451813348
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443	NC_020286	TTC	2	6	23802	23807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451813348
444	NC_020286	AAT	2	6	23850	23855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451813348
445	NC_020286	TGA	2	6	23935	23940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451813348
446	NC_020286	ATG	2	6	23973	23978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451813348
447	NC_020286	GTT	2	6	24124	24129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451813349
448	NC_020286	T	7	7	24128	24134	0 %	100 %	0 %	0 %	451813349
449	NC_020286	A	6	6	24162	24167	100 %	0 %	0 %	0 %	451813349
450	NC_020286	ATA	2	6	24200	24205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451813349
451	NC_020286	ATTG	2	8	24231	24238	25 %	50 %	25 %	0 %	451813349
452	NC_020286	TGT	3	9	24261	24269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451813349
453	NC_020286	ATA	2	6	24345	24350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451813349
454	NC_020286	ATT	2	6	24362	24367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451813349
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462	NC_020286	TCT	2	6	24624	24629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451813349
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465	NC_020286	TAT	2	6	24730	24735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451813349
466	NC_020286	AT	3	6	24828	24833	50 %	50 %	0 %	0 %	451813349
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472	NC_020286	TTG	2	6	25040	25045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451813349
473	NC_020286	GATC	2	8	25056	25063	25 %	25 %	25 %	25 %	451813349
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476	NC_020286	AAT	2	6	25147	25152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_020286	A	6	6	25409	25414	100 %	0 %	0 %	0 %	451813350
484	NC_020286	GAT	2	6	25428	25433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451813350
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